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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66632
Cell Name :  MMP9KO-1V1-LayerIII-1
Archive Name :  Murase
Species Name :  mouse
Strain :  MMP-9 -/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-26
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  MMP9KO-1V1-LayerIII-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Matrix Metalloproteinase-9 Regulates Neuronal Circuit Development and Excitability.

Measurements
Soma Surface :  11826.9 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  20
Overall Width :  124.12 μm
Overall Height :  204.08 μm
Overall Depth :  34.72 μm
Average Diameter :  0.75 μm
Total Length :  777.48 μm
Total Surface :  1982.82 μm2
Total Volume :  518.97 μm3
Max Euclidean Distance :  163.82 μm
Max Path Distance :  231.72 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  344
Partition Asymmetry :  0.29
Average Rall's Ratio :  1.76
Average Bifurcation Angle Local :  86.75°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.83°
Fractal Dimension :  1.04

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