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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66619
Cell Name :  MMP9KO-1HP-3
Archive Name :  Murase
Species Name :  mouse
Strain :  MMP-9 -/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-26
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  MMP9KO-1HP-3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Matrix Metalloproteinase-9 Regulates Neuronal Circuit Development and Excitability.

Measurements
Soma Surface :  11200.4 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  33
Number of Branches :  70
Overall Width :  177.14 μm
Overall Height :  300.9 μm
Overall Depth :  29.38 μm
Average Diameter :  0.81 μm
Total Length :  3217.09 μm
Total Surface :  8420.16 μm2
Total Volume :  2146.33 μm3
Max Euclidean Distance :  250.75 μm
Max Path Distance :  334.12 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  1782
Partition Asymmetry :  0.46
Average Rall's Ratio :  1.56
Average Bifurcation Angle Local :  90.26°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.61°
Fractal Dimension :  1.04

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