8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02643
Cell Name :  MJ090804-2-2
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  MJ090804-2-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Large-scale imaging of cortical network activity with calcium indicators

Measurements
Soma Surface :  981.36 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  158
Number of Branches :  322
Overall Width :  632.58 μm
Overall Height :  700.6 μm
Overall Depth :  38 μm
Average Diameter :  0.31 μm
Total Length :  12074.1 μm
Total Surface :  13283.9 μm2
Total Volume :  1828.94 μm3
Max Euclidean Distance :  580.74 μm
Max Path Distance :  786.08 μm
Max Branch Order :  23
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  6621
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.59
Average Bifurcation Angle Local :  77.74°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.74°
Fractal Dimension :  1.1

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