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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02642
Cell Name :  MJ090804-2-1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  MJ090804-2-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Large-scale imaging of cortical network activity with calcium indicators

Measurements
Soma Surface :  826.47 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  108
Number of Branches :  220
Overall Width :  328.87 μm
Overall Height :  713.9 μm
Overall Depth :  34.5 μm
Average Diameter :  0.29 μm
Total Length :  8863.99 μm
Total Surface :  8998.85 μm2
Total Volume :  1116.03 μm3
Max Euclidean Distance :  578 μm
Max Path Distance :  808.06 μm
Max Branch Order :  32
Average Contraction :  0.75
Total Fragmentation :  5025
Partition Asymmetry :  0.63
Average Rall's Ratio :  1.59
Average Bifurcation Angle Local :  73.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.81°
Fractal Dimension :  1.14

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