8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02638
Cell Name :  MJ090804-1-1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  MJ090804-1-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Large-scale imaging of cortical network activity with calcium indicators

Measurements
Soma Surface :  822.16 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  100
Number of Branches :  208
Overall Width :  866.25 μm
Overall Height :  471.85 μm
Overall Depth :  50 μm
Average Diameter :  0.3 μm
Total Length :  8506.79 μm
Total Surface :  8414.25 μm2
Total Volume :  928.18 μm3
Max Euclidean Distance :  622.84 μm
Max Path Distance :  902.5 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  3715
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  1.77
Average Bifurcation Angle Local :  78.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.4°
Fractal Dimension :  1.11

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website