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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02636
Cell Name :  MJ072004-1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  MJ072004-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Large-scale imaging of cortical network activity with calcium indicators

Measurements
Soma Surface :  458.21 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  43
Overall Width :  426.53 μm
Overall Height :  559.39 μm
Overall Depth :  26.5 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  3235.59 μm
Total Surface :  2754.22 μm2
Total Volume :  211.68 μm3
Max Euclidean Distance :  394.82 μm
Max Path Distance :  743.55 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.79
Total Fragmentation :  1801
Partition Asymmetry :  0.68
Average Rall's Ratio :  1.63
Average Bifurcation Angle Local :  78.54°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.73°
Fractal Dimension :  1.05

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