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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02625
Cell Name :  MJ050305-3
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  MJ050305-3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Large-scale imaging of cortical network activity with calcium indicators

Measurements
Soma Surface :  466.1 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  197
Number of Branches :  400
Overall Width :  1381.05 μm
Overall Height :  876.85 μm
Overall Depth :  53.5 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  15472 μm
Total Surface :  13445.2 μm2
Total Volume :  1133.02 μm3
Max Euclidean Distance :  1246.98 μm
Max Path Distance :  1484.67 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  8083
Partition Asymmetry :  0.71
Average Rall's Ratio :  1.93
Average Bifurcation Angle Local :  84.13°
Average Bifurcation Angle Remote :  80.04°
Fractal Dimension :  1.11

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