8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02621
Cell Name :  MJ030105-2-2
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  No Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  MJ030105-2-2.pvec
Note :  Only axon
 

Reference Article
Related Article Reference :  Large-scale imaging of cortical network activity with calcium indicators

Measurements
Soma Surface :  420.5 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  92
Number of Branches :  185
Overall Width :  515.37 μm
Overall Height :  826.69 μm
Overall Depth :  58.5 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  11259.1 μm
Total Surface :  8848.03 μm2
Total Volume :  556.16 μm3
Max Euclidean Distance :  681.44 μm
Max Path Distance :  1168.26 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  5933
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  2.32
Average Bifurcation Angle Local :  77.62°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.2°
Fractal Dimension :  1.09

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website