8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02620
Cell Name :  MJ030105-2-1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  MJ030105-2-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Large-scale imaging of cortical network activity with calcium indicators

Measurements
Soma Surface :  521.64 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  129
Number of Branches :  266
Overall Width :  734.55 μm
Overall Height :  1013.49 μm
Overall Depth :  46 μm
Average Diameter :  0.29 μm
Total Length :  13489.3 μm
Total Surface :  12700.5 μm2
Total Volume :  1158.33 μm3
Max Euclidean Distance :  952.42 μm
Max Path Distance :  1146.14 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  6986
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.75
Average Bifurcation Angle Local :  73.82°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.19°
Fractal Dimension :  1.09

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