8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_75893
Cell Name :  MDm1
Archive Name :  Hioki
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  350 grams
Max Weight :  450 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  thalamus
Secondary Brain Region :  mediodorsal thalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  medial
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  thalamocortical
Tertiary Cell Class :  glutamatergic, PFC-orbital projecting
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Corrected (no values given)
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-07-11
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  MDm1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Individual mediodorsal thalamic neurons project to multiple areas of the rat prefrontal cortex: A single neuron-tracing study using virus vectors.

Measurements
Soma Surface :  956.15 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  201
Number of Branches :  408
Overall Width :  293.91 μm
Overall Height :  386.62 μm
Overall Depth :  240.53 μm
Average Diameter :  1.34 μm
Total Length :  16202 μm
Total Surface :  62228.3 μm2
Total Volume :  32627.9 μm3
Max Euclidean Distance :  260.29 μm
Max Path Distance :  630.41 μm
Max Branch Order :  18
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  3987
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  2.43
Average Bifurcation Angle Local :  95.95°
Average Bifurcation Angle Remote :  82.74°
Fractal Dimension :  1.05

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