8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_75891
Cell Name :  MDc6
Archive Name :  Hioki
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  350 grams
Max Weight :  450 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  thalamus
Secondary Brain Region :  mediodorsal thalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  central
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  thalamocortical
Tertiary Cell Class :  glutamatergic, PFC-orbital projecting
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Corrected (no values given)
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-07-11
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  MDc6.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Individual mediodorsal thalamic neurons project to multiple areas of the rat prefrontal cortex: A single neuron-tracing study using virus vectors.

Measurements
Soma Surface :  1266.77 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  188
Number of Branches :  388
Overall Width :  227.74 μm
Overall Height :  356.44 μm
Overall Depth :  116.91 μm
Average Diameter :  0.41 μm
Total Length :  13718.5 μm
Total Surface :  17644.7 μm2
Total Volume :  1903.78 μm3
Max Euclidean Distance :  249.18 μm
Max Path Distance :  475.73 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  3959
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  2.11
Average Bifurcation Angle Local :  96.26°
Average Bifurcation Angle Remote :  80.5°
Fractal Dimension :  1.06

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