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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02581
Cell Name :  MD070401-2
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Mag-indo-1 AM
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  MD070401-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Two-photon photostimulation and imaging of neural circuits

Measurements
Soma Surface :  1258.65 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  62
Number of Branches :  133
Overall Width :  641.72 μm
Overall Height :  1373.48 μm
Overall Depth :  43.95 μm
Average Diameter :  0.62 μm
Total Length :  10593.5 μm
Total Surface :  20834.7 μm2
Total Volume :  3796.93 μm3
Max Euclidean Distance :  839.85 μm
Max Path Distance :  1194.79 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  28868
Partition Asymmetry :  0.59
Average Rall's Ratio :  1.58
Average Bifurcation Angle Local :  83.86°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.1°
Fractal Dimension :  1.06

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