8.6.78 - Released: 2025-04-04 - Content: 273808 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_277162
Cell Name :  M196_section2_image1_GFPneuron4_trace
Archive Name :  Schaaf_Zarbalis
Species Name :  mouse
Strain :  Wdfy3lacZ
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Wdfy3 homozygous
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-12-04
Date of Upload :  2024-03-07
Persistence Vector :  M196_section2_image1_GFPneuron4_trace.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  WDFY3 mutation alters laminar position and morphology of cortical neurons.

Measurements
Soma Surface :  458.14 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  6
Number of Branches :  18
Overall Width :  66.29 μm
Overall Height :  161.84 μm
Overall Depth :  0.47 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  644.52 μm
Total Surface :  2024.82 μm2
Total Volume :  506.2 μm3
Max Euclidean Distance :  135.01 μm
Max Path Distance :  160.48 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  828
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  13.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  48.03°
Fractal Dimension :  1.04

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