8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_277160
Cell Name :  M131_section3_image1_RFPneuron3_trace
Archive Name :  Schaaf_Zarbalis
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6NJ
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  td Tomato fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-12-04
Date of Upload :  2024-03-07
Persistence Vector :  M131_section3_image1_RFPneuron3_trace.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  WDFY3 mutation alters laminar position and morphology of cortical neurons.

Measurements
Soma Surface :  473.14 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  25
Overall Width :  70.62 μm
Overall Height :  217.83 μm
Overall Depth :  0.56 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  724.63 μm
Total Surface :  2276.49 μm2
Total Volume :  569.12 μm3
Max Euclidean Distance :  197.05 μm
Max Path Distance :  212.21 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  951
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  21.21°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.03°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website