8.6.74 - Released: 2025-03-12 - Content: 273509 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_277069
Cell Name :  M131_section3_image1_RFPneuron2_trace
Archive Name :  Schaaf_Zarbalis
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6NJ
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  td Tomato fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-12-04
Date of Upload :  2024-03-07
Persistence Vector :  M131_section3_image1_RFPneuron2_trace.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  WDFY3 mutation alters laminar position and morphology of cortical neurons.

Measurements
Soma Surface :  277.73 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  25
Overall Width :  147.19 μm
Overall Height :  181.49 μm
Overall Depth :  0.22 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  814.62 μm
Total Surface :  2559.2 μm2
Total Volume :  639.8 μm3
Max Euclidean Distance :  182.72 μm
Max Path Distance :  205.02 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1094
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  25.6°
Average Bifurcation Angle Remote :  90.1°
Fractal Dimension :  1.04

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