8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_277089
Cell Name :  M131_section3_image1_HETneuron1_trace
Archive Name :  Schaaf_Zarbalis
Species Name :  mouse
Strain :  Wdfy3lacZ-MADM-5
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Wdfy3 heterozygous
Staining Method :  td Tomato fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-12-04
Date of Upload :  2024-03-07
Persistence Vector :  M131_section3_image1_HETneuron1_trace.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  WDFY3 mutation alters laminar position and morphology of cortical neurons.

Measurements
Soma Surface :  607.26 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  38
Overall Width :  144.11 μm
Overall Height :  345.47 μm
Overall Depth :  0.05 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  1467.98 μm
Total Surface :  4611.8 μm2
Total Volume :  1152.95 μm3
Max Euclidean Distance :  298.99 μm
Max Path Distance :  333.25 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1946
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  22.41°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.19°
Fractal Dimension :  1.04

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