8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_277072
Cell Name :  M100_section4_image1_RFPneuron5_trace
Archive Name :  Schaaf_Zarbalis
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6NJ
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  td Tomato fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-12-04
Date of Upload :  2024-03-07
Persistence Vector :  M100_section4_image1_RFPneuron5_trace.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  WDFY3 mutation alters laminar position and morphology of cortical neurons.

Measurements
Soma Surface :  97.41 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  25
Overall Width :  58.42 μm
Overall Height :  113.6 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  510.51 μm
Total Surface :  1603.82 μm2
Total Volume :  400.95 μm3
Max Euclidean Distance :  77.37 μm
Max Path Distance :  104.47 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  692
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  23.45°
Average Bifurcation Angle Remote :  92.01°
Fractal Dimension :  1.05

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