8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_277114
Cell Name :  M100_section4_image1_RFPneuron4_trace
Archive Name :  Schaaf_Zarbalis
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6NJ
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  td Tomato fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-12-04
Date of Upload :  2024-03-07
Persistence Vector :  M100_section4_image1_RFPneuron4_trace.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  WDFY3 mutation alters laminar position and morphology of cortical neurons.

Measurements
Soma Surface :  122.92 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  26
Overall Width :  74.82 μm
Overall Height :  101.88 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  551.5 μm
Total Surface :  1732.6 μm2
Total Volume :  433.15 μm3
Max Euclidean Distance :  84.41 μm
Max Path Distance :  91.98 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  738
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  16.95°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.7°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website