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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02574
Cell Name :  M060405SL1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  M060405SL1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Large-scale imaging of cortical network activity with calcium indicators

Measurements
Soma Surface :  554.48 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  340
Number of Branches :  688
Overall Width :  556.44 μm
Overall Height :  1061.82 μm
Overall Depth :  35.32 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  12925 μm
Total Surface :  11291.6 μm2
Total Volume :  926.55 μm3
Max Euclidean Distance :  773.13 μm
Max Path Distance :  1299.38 μm
Max Branch Order :  68
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  17446
Partition Asymmetry :  0.77
Average Rall's Ratio :  1.95
Average Bifurcation Angle Local :  86.64°
Average Bifurcation Angle Remote :  84.7°
Fractal Dimension :  1.05

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