8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_268443
Cell Name :  Lopez-Virgen_Sensorimotor_184
Archive Name :  Sensorimotor_Lab
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  40.0 days
Max Age :  40.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  pyramidal tract (PT) cell Sim1+, Thick-tufted, corticopontine
Original Format :  Amira.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Biocytin, streptavidin-488
Slicing Direction :  tangential
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Amira
Date of Deposition :  2023-02-23
Date of Upload :  2023-06-28
Persistence Vector :  Lopez-Virgen_Sensorimotor_184.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Different subtypes of motor cortex pyramidal tract neurons projects to red and pontine nuclei.

Measurements
Soma Surface :  763.48 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  136
Number of Branches :  284
Overall Width :  267.96 μm
Overall Height :  558.8 μm
Overall Depth :  184.08 μm
Average Diameter :  0.17 μm
Total Length :  10081.4 μm
Total Surface :  5825.37 μm2
Total Volume :  443.82 μm3
Max Euclidean Distance :  544.6 μm
Max Path Distance :  727.69 μm
Max Branch Order :  32
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  14482
Partition Asymmetry :  0.59
Average Rall's Ratio :  3.02
Average Bifurcation Angle Local :  81.57°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.66°
Fractal Dimension :  1.1

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website