8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_119389
Cell Name :  Liu_XD_8_57
Archive Name :  Liu_XD
Species Name :  mouse
Strain :  ICR
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  0.0 day
Max Age :  0.0 day
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  neonatal
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  GCaMP3
Staining Method :  cyan fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2018-06-30
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  Liu_XD_8_57.pvec
Note :  7 DIV

Reference Article
Related Article Reference :  Improved calcium sensor GCaMP-X overcomes the calcium channel perturbations induced by the calmodulin in GCaMP.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  8
Overall Width :  68.13 μm
Overall Height :  172.89 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  2.08 μm
Total Length :  383.78 μm
Total Surface :  2512.61 μm2
Total Volume :  1309.07 μm3
Max Euclidean Distance :  146.88 μm
Max Path Distance :  220 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  1873
Partition Asymmetry :  0.75
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  119°
Average Bifurcation Angle Remote :  103.42°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website