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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_50693
Cell Name :  Lgi1KO-Neuron-5
Archive Name :  Baulac
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J Lgi1-/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  9.0 days
Max Age :  9.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  glutamatergic
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-27
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  Lgi1KO-Neuron-5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  LGI1 acts presynaptically to regulate excitatory synaptic transmission during early postnatal development.

Measurements
Soma Surface :  1138.23 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  36
Number of Branches :  79
Overall Width :  181.78 μm
Overall Height :  329.42 μm
Overall Depth :  51.43 μm
Average Diameter :  0.52 μm
Total Length :  2260.53 μm
Total Surface :  3776.59 μm2
Total Volume :  838.89 μm3
Max Euclidean Distance :  286.89 μm
Max Path Distance :  388.36 μm
Max Branch Order :  26
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  1428
Partition Asymmetry :  0.68
Average Rall's Ratio :  1.21
Average Bifurcation Angle Local :  77.33°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.01°
Fractal Dimension :  1.06

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