8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_50691
Cell Name :  Lgi1KO-Neuron-3
Archive Name :  Baulac
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J Lgi1-/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  9.0 days
Max Age :  9.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  glutamatergic
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-27
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  Lgi1KO-Neuron-3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  LGI1 acts presynaptically to regulate excitatory synaptic transmission during early postnatal development.

Measurements
Soma Surface :  1162.35 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  48
Number of Branches :  101
Overall Width :  126.34 μm
Overall Height :  298.33 μm
Overall Depth :  22.94 μm
Average Diameter :  0.74 μm
Total Length :  2297.03 μm
Total Surface :  5766.12 μm2
Total Volume :  2199.53 μm3
Max Euclidean Distance :  321.91 μm
Max Path Distance :  420.98 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  1454
Partition Asymmetry :  0.69
Average Rall's Ratio :  1.38
Average Bifurcation Angle Local :  73.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.49°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website