8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36625
Cell Name :  LK06-OLM-1-root
Archive Name :  Somogyi
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.8 months
Max Age :  5.3 months
Gender :  Male
Min Weight :  375 grams
Max Weight :  375 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum oriens
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  oriens-lacunosum moleculare (OLM), Somatostatin (SOM)-positive, Calbindin (CB)-negative, mGluR1alpha-positive, Parvalbumin (PV)-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  70  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Corrected (no values given)
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-06-15
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  LK06-OLM-1-root.pvec
Note :  Dendrites from all 11 of 11 sections; axon from 3 representative of 24 sections.

Reference Article
Related Article Reference :  Sleep and movement differentiates actions of two types of somatostatin-expressing GABAergic interneuron in rat hippocampus.

Measurements
Soma Surface :  454.69 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  688
Number of Branches :  1381
Overall Width :  1015.8 μm
Overall Height :  1121.91 μm
Overall Depth :  611.89 μm
Average Diameter :  0.41 μm
Total Length :  53964.6 μm
Total Surface :  70957.9 μm2
Total Volume :  12185.8 μm3
Max Euclidean Distance :  1137.74 μm
Max Path Distance :  2787.26 μm
Max Branch Order :  75
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  76761
Partition Asymmetry :  0.66
Average Rall's Ratio :  1.95
Average Bifurcation Angle Local :  84.59°
Average Bifurcation Angle Remote :  88.81°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website