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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_61657
Cell Name :  L5pyr-j150623e
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Multiple
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  7.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  18 grams
Max Weight :  36 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-22
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  L5pyr-j150623e.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Principles of connectivity among morphologically defined cell types in adult neocortex.

Measurements
Soma Surface :  1421.36 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  50
Number of Branches :  112
Overall Width :  639.45 μm
Overall Height :  694.33 μm
Overall Depth :  139.57 μm
Average Diameter :  0.73 μm
Total Length :  10861.8 μm
Total Surface :  22583 μm2
Total Volume :  5446.66 μm3
Max Euclidean Distance :  510.56 μm
Max Path Distance :  748.55 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  7966
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  1.49
Average Bifurcation Angle Local :  88.73°
Average Bifurcation Angle Remote :  67.73°
Fractal Dimension :  1.07

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