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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_61655
Cell Name :  L5pyr-j140717b
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Multiple
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  7.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  18 grams
Max Weight :  36 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-22
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  L5pyr-j140717b.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Principles of connectivity among morphologically defined cell types in adult neocortex.

Measurements
Soma Surface :  1417.62 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  103
Number of Branches :  215
Overall Width :  395.59 μm
Overall Height :  1118.85 μm
Overall Depth :  97.77 μm
Average Diameter :  0.52 μm
Total Length :  16817.4 μm
Total Surface :  25054 μm2
Total Volume :  4752.55 μm3
Max Euclidean Distance :  687.39 μm
Max Path Distance :  1365.48 μm
Max Branch Order :  23
Average Contraction :  0.71
Total Fragmentation :  13742
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  1.61
Average Bifurcation Angle Local :  80.97°
Average Bifurcation Angle Remote :  83.97°
Fractal Dimension :  1.09

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