8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283210
Cell Name :  L4_Pyr
Archive Name :  Maffei
Species Name :  rat
Strain :  Long-Evans
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2024-06-06
Date of Upload :  2024-06-07
Persistence Vector :  L4_Pyr.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Layer-specific Developmental Changes in Excitation and Inhibition in Rat Primary Visual Cortex.

Measurements
Soma Surface :  641.68 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  42
Overall Width :  228.2 μm
Overall Height :  638.63 μm
Overall Depth :  189.93 μm
Average Diameter :  1.48 μm
Total Length :  3679.85 μm
Total Surface :  17109.7 μm2
Total Volume :  6330.58 μm3
Max Euclidean Distance :  541.58 μm
Max Path Distance :  757.81 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  1364
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  84.59°
Average Bifurcation Angle Remote :  57.52°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website