8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07188
Cell Name :  KP092908fluo-4f
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Multiple
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 49% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-07-29
Date of Upload :  2011-11-08
Persistence Vector :  KP092908fluo-4f.pvec
Note :  Secondary brain region- somatosensory or visual cortex
 

Reference Article
Related Article Reference :  Two-photon photostimulation and imaging of neural circuits.

Measurements
Soma Surface :  581.65 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  28
Number of Branches :  62
Overall Width :  309.78 μm
Overall Height :  710.47 μm
Overall Depth :  35.52 μm
Average Diameter :  0.48 μm
Total Length :  3911.89 μm
Total Surface :  5742.01 μm2
Total Volume :  769.61 μm3
Max Euclidean Distance :  491.61 μm
Max Path Distance :  578.83 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  10114
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  1.57
Average Bifurcation Angle Local :  84.07°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.04°
Fractal Dimension :  1.03

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