8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07186
Cell Name :  KP071808s1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Multiple
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 49% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-07-29
Date of Upload :  2011-11-08
Persistence Vector :  KP071808s1.pvec
Note :  Secondary brain region- somatosensory or visual cortex
 

Reference Article
Related Article Reference :  Two-photon photostimulation and imaging of neural circuits.

Measurements
Soma Surface :  646.52 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  32
Number of Branches :  71
Overall Width :  428.01 μm
Overall Height :  206.72 μm
Overall Depth :  46.37 μm
Average Diameter :  0.33 μm
Total Length :  3415.67 μm
Total Surface :  3813.72 μm2
Total Volume :  508.77 μm3
Max Euclidean Distance :  340.85 μm
Max Path Distance :  405.89 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.77
Total Fragmentation :  10582
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  1.31
Average Bifurcation Angle Local :  89.64°
Average Bifurcation Angle Remote :  67.1°
Fractal Dimension :  1.04

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