8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07185
Cell Name :  KP061608cell2
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Multiple
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 49% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-07-29
Date of Upload :  2011-11-08
Persistence Vector :  KP061608cell2.pvec
Note :  Secondary brain region- somatosensory or visual cortex
 

Reference Article
Related Article Reference :  Two-photon photostimulation and imaging of neural circuits.

Measurements
Soma Surface :  825.18 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  73
Number of Branches :  152
Overall Width :  314.27 μm
Overall Height :  892.96 μm
Overall Depth :  69.45 μm
Average Diameter :  0.31 μm
Total Length :  6787.38 μm
Total Surface :  5996.97 μm2
Total Volume :  1020.73 μm3
Max Euclidean Distance :  749.94 μm
Max Path Distance :  921.9 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  11117
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  1.47
Average Bifurcation Angle Local :  70.73°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.2°
Fractal Dimension :  1.02

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