8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07178
Cell Name :  KP052008cell2
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Multiple
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 49% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-07-29
Date of Upload :  2011-11-08
Persistence Vector :  KP052008cell2.pvec
Note :  Secondary brain region- somatosensory or visual cortex
 

Reference Article
Related Article Reference :  Two-photon photostimulation and imaging of neural circuits.

Measurements
Soma Surface :  500.89 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  37
Number of Branches :  79
Overall Width :  229.68 μm
Overall Height :  461.88 μm
Overall Depth :  38.09 μm
Average Diameter :  0.39 μm
Total Length :  3816.03 μm
Total Surface :  4907.52 μm2
Total Volume :  860.41 μm3
Max Euclidean Distance :  372.4 μm
Max Path Distance :  464.87 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  9166
Partition Asymmetry :  0.39
Average Rall's Ratio :  1.12
Average Bifurcation Angle Local :  58.09°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.07°
Fractal Dimension :  1.04

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