8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283426
Cell Name :  KObJ_MO_V_VI
Archive Name :  Komulainen
Species Name :  mouse
Strain :  Jnk1-/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  7.0 months
Max Age :  7.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  motor, primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  c-Jun N-terminal kinase 1 (JNK1) knockout
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  180  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2024-05-19
Date of Upload :  2024-07-15
Persistence Vector :  KObJ_MO_V_VI.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  JNK1 controls dendritic field size in L2/3 and L5 of the motor cortex, constrains soma size, and influences fine motor coordination.

Measurements
Soma Surface :  1251.51 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  6
Number of Branches :  13
Overall Width :  120.32 μm
Overall Height :  141.78 μm
Overall Depth :  30.55 μm
Average Diameter :  0.12 μm
Total Length :  686.8 μm
Total Surface :  267.71 μm2
Total Volume :  8.38 μm3
Max Euclidean Distance :  162 μm
Max Path Distance :  180.44 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  148
Partition Asymmetry :  0.32
Average Rall's Ratio :  2.03
Average Bifurcation Angle Local :  58.9°
Average Bifurcation Angle Remote :  35.73°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website