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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_136355
Cell Name :  KO_HIF1a_3_3
Archive Name :  Soriano
Species Name :  mouse
Strain :  HIF1alpha floxed UBC-CRE-ERT2
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Hypoxia Inducible Factor 1 Alpha (HIF1A) gene innactivation
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2020-03-24
Date of Upload :  2020-08-10
Persistence Vector :  KO_HIF1a_3_3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Synaptic activity-induced glycolysis facilitates membrane lipid provision and neurite outgrowth.

Measurements
Soma Surface :  1077.26 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  56
Overall Width :  346.6 μm
Overall Height :  601.53 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2686.83 μm
Total Surface :  2110.23 μm2
Total Volume :  131.89 μm3
Max Euclidean Distance :  602.11 μm
Max Path Distance :  646.03 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  3362
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  20.86°
Average Bifurcation Angle Remote :  47.94°
Fractal Dimension :  1.01

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