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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_136669
Cell Name :  KO_HIF1a_2_5
Archive Name :  Soriano
Species Name :  mouse
Strain :  HIF1alpha floxed UBC-CRE-ERT2
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Hypoxia Inducible Factor 1 Alpha (HIF1A) gene innactivation
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2020-03-24
Date of Upload :  2020-08-10
Persistence Vector :  KO_HIF1a_2_5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Synaptic activity-induced glycolysis facilitates membrane lipid provision and neurite outgrowth.

Measurements
Soma Surface :  918.25 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  23
Overall Width :  158.14 μm
Overall Height :  673.32 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2017.36 μm
Total Surface :  1584.43 μm2
Total Volume :  99.03 μm3
Max Euclidean Distance :  677.08 μm
Max Path Distance :  724.48 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  2494
Partition Asymmetry :  0.75
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  8.95°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.79°
Fractal Dimension :  1.01

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