8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_75719
Cell Name :  KO6-3gfp
Archive Name :  Higgs
Species Name :  mouse
Strain :  Rhot1
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  16.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2017-03-31
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  KO6-3gfp.pvec
Note :  14 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Loss of Dendritic Complexity Precedes Neurodegeneration in a Mouse Model with Disrupted Mitochondrial Distribution in Mature Dendrites.

Measurements
Soma Surface :  55.61 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  23
Number of Branches :  54
Overall Width :  64.91 μm
Overall Height :  70.64 μm
Overall Depth :  0.8 μm
Average Diameter :  0.36 μm
Total Length :  563.16 μm
Total Surface :  591.58 μm2
Total Volume :  66.57 μm3
Max Euclidean Distance :  61.18 μm
Max Path Distance :  61.73 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.98
Total Fragmentation :  166
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  1.84
Average Bifurcation Angle Local :  52.46°
Average Bifurcation Angle Remote :  47.45°
Fractal Dimension :  1.01

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