8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66756
Cell Name :  KO2
Archive Name :  Newbern
Species Name :  mouse
Strain :  transgenic
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  17.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  27 grams
Max Weight :  28 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-01-16
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  KO2.pvec
Note :  Animals were mixed, Mek1-/- Mek2loxp/loxp Nex:Cre

Reference Article
Related Article Reference :  Layer specific and general requirements for ERK/MAPK signaling in the developing neocortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  47
Number of Branches :  96
Overall Width :  282.76 μm
Overall Height :  263.71 μm
Overall Depth :  78.31 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  3896.31 μm
Total Surface :  24481.3 μm2
Total Volume :  12240.6 μm3
Max Euclidean Distance :  220.1 μm
Max Path Distance :  290.71 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  2999
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  70.1°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.12°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website