8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36597
Cell Name :  KB-2010728
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  20.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  water
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2014-11-26
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  KB-2010728.pvec
Note :  Slicing direction is roughly coronal

Reference Article
Related Article Reference :  Target-specific expression of presynaptic NMDA receptors in neocortical microcircuits.

Measurements
Soma Surface :  5259.03 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  72
Number of Branches :  150
Overall Width :  760.1 μm
Overall Height :  1606.03 μm
Overall Depth :  119 μm
Average Diameter :  3.23 μm
Total Length :  15143.2 μm
Total Surface :  158613 μm2
Total Volume :  148389 μm3
Max Euclidean Distance :  1203.06 μm
Max Path Distance :  1424.98 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  1016
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2.26
Average Bifurcation Angle Local :  69.88°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.35°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website