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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36593
Cell Name :  KB-20100729
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  20.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  water
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2014-11-26
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  KB-20100729.pvec
Note :  Slicing direction is roughly coronal

Reference Article
Related Article Reference :  Target-specific expression of presynaptic NMDA receptors in neocortical microcircuits.

Measurements
Soma Surface :  9059.42 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  69
Number of Branches :  149
Overall Width :  813.54 μm
Overall Height :  1570.8 μm
Overall Depth :  125 μm
Average Diameter :  2.76 μm
Total Length :  15089.2 μm
Total Surface :  140772 μm2
Total Volume :  126899 μm3
Max Euclidean Distance :  1156.56 μm
Max Path Distance :  1420.09 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  1162
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2.35
Average Bifurcation Angle Local :  64.64°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.72°
Fractal Dimension :  1.01

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