8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_86706
Cell Name :  JV1208_3
Archive Name :  Valero_Malva
Species Name :  mouse
Strain :  129/C57BL6
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.9 months
Max Age :  5.9 months
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer, septal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  newborn, Doublecortin (DCX)-containing
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Morris water maze, 3xTgAD, liposaccharide injection
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 45%
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2017-09-16
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  JV1208_3.pvec
Note :  LPS (1mg/kg). Tissue shrinkage: 40-50% (not corrected)

Reference Article
Related Article Reference :  Long-term effects of an acute and systemic administration of LPS on adult neurogenesis and spatial memory.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  11
Overall Width :  47.69 μm
Overall Height :  71.92 μm
Overall Depth :  10 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  263.3 μm
Total Surface :  413.58 μm2
Total Volume :  51.7 μm3
Max Euclidean Distance :  80.88 μm
Max Path Distance :  105.18 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  647
Partition Asymmetry :  0.8
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  21.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  53.29°
Fractal Dimension :  1.09

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website