8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_86691
Cell Name :  JV1176_1
Archive Name :  Valero_Malva
Species Name :  mouse
Strain :  129/C57BL6
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.9 months
Max Age :  5.9 months
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer, septal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  newborn, Doublecortin (DCX)-containing
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Morris water maze, 3xTgAD, liposaccharide injection
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 45%
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2017-09-16
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  JV1176_1.pvec
Note :  LPS (1mg/kg). Tissue shrinkage: 40-50% (not corrected)

Reference Article
Related Article Reference :  Long-term effects of an acute and systemic administration of LPS on adult neurogenesis and spatial memory.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  17
Overall Width :  51.94 μm
Overall Height :  122.37 μm
Overall Depth :  5 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  379.6 μm
Total Surface :  596.27 μm2
Total Volume :  74.53 μm3
Max Euclidean Distance :  139.25 μm
Max Path Distance :  162.14 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  983
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  19.6°
Average Bifurcation Angle Remote :  41.93°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website