8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_194307
Cell Name :  JS130-2LB_CA_HC_S2L_CA1_3-f
Archive Name :  Gareau
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  42.0 days
Max Age :  56.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 546
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2022-06-18
Date of Upload :  2022-08-10
Persistence Vector :  JS130-2LB_CA_HC_S2L_CA1_3-f.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Neonatal Enteropathogenic Escherichia coli Infection Disrupts Microbiota-Gut-Brain Axis Signaling.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  233
Number of Branches :  468
Overall Width :  28.63 μm
Overall Height :  60.58 μm
Overall Depth :  52.96 μm
Average Diameter :  0.71 μm
Total Length :  1772.95 μm
Total Surface :  3990.76 μm2
Total Volume :  794 μm3
Max Euclidean Distance :  43.44 μm
Max Path Distance :  119.56 μm
Max Branch Order :  32
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  11690
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2.04
Average Bifurcation Angle Local :  44.07°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.77°
Fractal Dimension :  1.06

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