8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_194182
Cell Name :  JS130-2LB_CA_HC_S2L_CA1_3-d
Archive Name :  Gareau
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  42.0 days
Max Age :  56.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 546
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2022-06-18
Date of Upload :  2022-08-10
Persistence Vector :  JS130-2LB_CA_HC_S2L_CA1_3-d.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Neonatal Enteropathogenic Escherichia coli Infection Disrupts Microbiota-Gut-Brain Axis Signaling.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  106
Number of Branches :  214
Overall Width :  38.11 μm
Overall Height :  25.63 μm
Overall Depth :  58.69 μm
Average Diameter :  0.78 μm
Total Length :  890.44 μm
Total Surface :  2206.74 μm2
Total Volume :  471.05 μm3
Max Euclidean Distance :  37.39 μm
Max Path Distance :  61.66 μm
Max Branch Order :  25
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  5778
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2.02
Average Bifurcation Angle Local :  45.78°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.53°
Fractal Dimension :  1.05

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