8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33802
Cell Name :  JR34-PL-5
Archive Name :  Radley
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  275 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-01-02
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  JR34-PL-5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chronic stress-induced alterations of dendritic spine subtypes predict functional decrements in an hypothalamo-pituitary-adrenal-inhibitory prefrontal circuit.

Measurements
Soma Surface :  654.11 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  38
Overall Width :  203.26 μm
Overall Height :  292.7 μm
Overall Depth :  96.65 μm
Average Diameter :  0.76 μm
Total Length :  2513.79 μm
Total Surface :  6229 μm2
Total Volume :  3349.52 μm3
Max Euclidean Distance :  271.52 μm
Max Path Distance :  317.35 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  850
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  62.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.22°
Fractal Dimension :  1.03

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