8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33968
Cell Name :  JR33-vSUB-1
Archive Name :  Radley
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  275 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  subiculum
Secondary Brain Region :  stratum pyramidale
Tertiary Brain Region :  ventral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chronic variable stress (CVS)
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-01-02
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  JR33-vSUB-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chronic stress-induced alterations of dendritic spine subtypes predict functional decrements in an hypothalamo-pituitary-adrenal-inhibitory prefrontal circuit.

Measurements
Soma Surface :  434.9 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  36
Overall Width :  180.08 μm
Overall Height :  480.83 μm
Overall Depth :  156.64 μm
Average Diameter :  1.28 μm
Total Length :  2841.24 μm
Total Surface :  11546.2 μm2
Total Volume :  4751.66 μm3
Max Euclidean Distance :  384.28 μm
Max Path Distance :  576.01 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  924
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  86.43°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.12°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website