8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33913
Cell Name :  JR33-PL-2
Archive Name :  Radley
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  275 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chronic variable stress (CVS)
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-01-02
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  JR33-PL-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chronic stress-induced alterations of dendritic spine subtypes predict functional decrements in an hypothalamo-pituitary-adrenal-inhibitory prefrontal circuit.

Measurements
Soma Surface :  573.68 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  24
Number of Branches :  53
Overall Width :  162.73 μm
Overall Height :  261.22 μm
Overall Depth :  193.9 μm
Average Diameter :  0.57 μm
Total Length :  3219.66 μm
Total Surface :  5912.07 μm2
Total Volume :  2646.65 μm3
Max Euclidean Distance :  219.93 μm
Max Path Distance :  371.65 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  1062
Partition Asymmetry :  0.21
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  90.75°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.4°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website