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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33912
Cell Name :  JR33-PL-11
Archive Name :  Radley
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  275 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chronic variable stress (CVS)
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-01-02
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  JR33-PL-11.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chronic stress-induced alterations of dendritic spine subtypes predict functional decrements in an hypothalamo-pituitary-adrenal-inhibitory prefrontal circuit.

Measurements
Soma Surface :  682.33 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  27
Number of Branches :  60
Overall Width :  182.83 μm
Overall Height :  320.25 μm
Overall Depth :  115.27 μm
Average Diameter :  1.15 μm
Total Length :  3709.64 μm
Total Surface :  13242.7 μm2
Total Volume :  6662.03 μm3
Max Euclidean Distance :  284.16 μm
Max Path Distance :  360.53 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  1239
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  1.9
Average Bifurcation Angle Local :  75.09°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.31°
Fractal Dimension :  1.04

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