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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33910
Cell Name :  JR33-PL-1
Archive Name :  Radley
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  275 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chronic variable stress (CVS)
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-01-02
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  JR33-PL-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chronic stress-induced alterations of dendritic spine subtypes predict functional decrements in an hypothalamo-pituitary-adrenal-inhibitory prefrontal circuit.

Measurements
Soma Surface :  574.29 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  24
Number of Branches :  53
Overall Width :  233.82 μm
Overall Height :  390.15 μm
Overall Depth :  151.2 μm
Average Diameter :  0.71 μm
Total Length :  3636.57 μm
Total Surface :  8201.48 μm2
Total Volume :  3301.78 μm3
Max Euclidean Distance :  281.79 μm
Max Path Distance :  382.61 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  1183
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  2.03
Average Bifurcation Angle Local :  74.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.01°
Fractal Dimension :  1.04

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