8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33856
Cell Name :  JR31-vSUB-11
Archive Name :  Radley
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  275 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  subiculum
Secondary Brain Region :  stratum pyramidale
Tertiary Brain Region :  ventral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-01-02
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  JR31-vSUB-11.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chronic stress-induced alterations of dendritic spine subtypes predict functional decrements in an hypothalamo-pituitary-adrenal-inhibitory prefrontal circuit.

Measurements
Soma Surface :  880.03 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  36
Overall Width :  157.45 μm
Overall Height :  448.91 μm
Overall Depth :  164.97 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  2973.54 μm
Total Surface :  9659.8 μm2
Total Volume :  5827.02 μm3
Max Euclidean Distance :  410.76 μm
Max Path Distance :  557.6 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  872
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  1.94
Average Bifurcation Angle Local :  66.26°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.68°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website