8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33787
Cell Name :  JR14-PL-3
Archive Name :  Radley
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  275 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-01-02
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  JR14-PL-3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chronic stress-induced alterations of dendritic spine subtypes predict functional decrements in an hypothalamo-pituitary-adrenal-inhibitory prefrontal circuit.

Measurements
Soma Surface :  544.18 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  49
Number of Branches :  104
Overall Width :  256.12 μm
Overall Height :  581.83 μm
Overall Depth :  162.07 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  7639.06 μm
Total Surface :  13906.8 μm2
Total Volume :  5357.71 μm3
Max Euclidean Distance :  350.68 μm
Max Path Distance :  487.48 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  2620
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  2.91
Average Bifurcation Angle Local :  93.42°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.28°
Fractal Dimension :  1.05

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