8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_33818
Cell Name :  JR13-vSUB-1
Archive Name :  Radley
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  275 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  subiculum
Secondary Brain Region :  stratum pyramidale
Tertiary Brain Region :  ventral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-01-02
Date of Upload :  2015-10-06
Persistence Vector :  JR13-vSUB-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chronic stress-induced alterations of dendritic spine subtypes predict functional decrements in an hypothalamo-pituitary-adrenal-inhibitory prefrontal circuit.

Measurements
Soma Surface :  1012.14 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  40
Overall Width :  233.42 μm
Overall Height :  404.03 μm
Overall Depth :  174.19 μm
Average Diameter :  1.83 μm
Total Length :  2871.88 μm
Total Surface :  16971.4 μm2
Total Volume :  11646 μm3
Max Euclidean Distance :  365.21 μm
Max Path Distance :  493.58 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  1040
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  81.59°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.42°
Fractal Dimension :  1.04

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